Épidémiologie de la colonisation par Staphylococcus aureus chez les résidents des foyers de soins

Contexte Nous avons cherché à caractériser les caractéristiques épidémiologiques cliniques et moléculaires de la colonisation par Staphylococcus aureus, en particulier la colonisation extranasale, et à déterminer dans quelle mesure le SARM S aureus méthicillinorésistant associé à la communauté est apparu dans les maisons de repos communautaires. Des échantillons ont été prélevés dans les narines, l’oropharynx, l’aine, la région périanale, les plaies et le tube entéral. Des méthodes microbiologiques standard ont été utilisées pour identifier les S aureus sensibles à la méthicilline et les méthodes épidémiologiques moléculaires incluses. Résultats: Cent trente et un résidents ont été colonisés par S aureus. La colonisation par le SARM a eu lieu dans% des résidents ayant des dispositifs à demeure et dans% des résidents. sans devic à demeure es P & lt; Parmi les résidents qui ont été colonisés par le SARM, les résultats de culture de nares étaient positifs seulement pour% Les résidents avec des dispositifs en place étaient plus susceptibles d’être colonisés à plusieurs sites Onze souches différentes de SARM ont été identifiées par électrophorèse sur gel en champ pulsé Soixante-treize résidents étaient colonisés avec des souches SCCmec II associées à l’hôpital, et% ont été colonisés avec des souches SCCmec IV associées à la communauté, dont Panton-Valentine leucocidinConclusions colonisation extranasale avec SARM est fréquente chez les résidents des maisons de soins infirmiers – en particulier chez les résidents avec un dispositif à domicile Nous avons documenté l’émergence des souches de SARM SCCmec IV associées à la communauté dans le milieu de soins infirmiers communautaires du sud-est du Michigan

Les narines antérieures sont présumées être le principal réservoir de Staphylococcus aureus L’épidémiologie de la colonisation nasale par S aureus est bien définie, mais la colonisation extranasale a été moins bien étudiée. aux sites extra-nasaux; par exemple, le taux de colonisation oropharyngée chez les adultes en bonne santé variait de% à% Une étude récente a révélé que% des membres d’une population ambulatoire saine portaient S aureus dans l’oropharynx mais pas dans les narres , et un autre Une étude de la Suisse a noté que% des personnes dépistées portaient S aureus seulement dans l’oropharynx et non dans les narines Sans surprise, les taux de colonisation nasale et extranasale avec S aureus résistant à la méticilline MRSA semblent similaires à ceux notés pour S aureus en général Dans une étude sur des adultes hospitalisés pour lesquels des échantillons ont été prélevés dans les narines, le rectum et les aisselles, il a été montré que% des patients colonisés par SARM auraient été oubliés si un prélèvement rectal n’avait pas été effectué. étude de patients en unité de soins intensifs,% de patients colonisés seraient restés non détectés si un dépistage multisite complet du SARM n’avait pas été effectué au moment de l’admission Observations chez les patients avec SARM d’origine communautaire L’infection par SARM-CA – un problème émergent aux États-Unis et en Europe – suggère que la colonisation extranasale peut être plus fréquente que ce qui a été noté précédemment avec les souches hospitalières de SARM Il existe peu de données sur la prévalence de S aureus. Chez les résidents des foyers de soins communautaires, des études antérieures de notre groupe et d’autres ont montré que les appareils à demeure, tels que les cathéters urinaires et les tubes d’alimentation, ainsi que les facteurs de risque de colonisation. La dépendance est un facteur important de la colonisation nasale chez les résidents des foyers de soins Notre étude évalue l’épidémiologie clinique de la colonisation de S aureus dans cette population, en mettant l’accent sur l’épidémiologie moléculaire du SARM. Nous avons émis l’hypothèse que les résidents fardeau bactérien et serait colonisé par le SASM ou le SARM à plusieurs sites extranasaux, comparativement aux résidents qui ne disposait pas de tels dispositifs Nous avons caractérisé l’épidémiologie moléculaire du SARM dans les maisons de soins communautaires, en notant les souches typiques associées aux hôpitaux et les souches de SARM dans ce contexte

Méthodes

Conception de l’étude et population Nous avons mené une étude épidémiologique transversale portant sur les foyers de soins communautaires du sud-est du Michigan entre mars et novembre. Dans chaque foyer de soins, tous les spécimens de culture ont été obtenus en une semaine. Ce projet a été approuvé par l’Université du Michigan. Le consentement éclairé écrit a été obtenu de tous les résidents admissibles Si un résident n’était pas en mesure de fournir un consentement éclairé en raison de difficultés cognitives documentées, un consentement éclairé écrit a été obtenu de sa procuration durable Résidents à domicile ayant des urines cathéter, un tube de gastrostomie percutanée, ou un cathéter intraveineux central ont été inscrits Un nombre égal de résidents sans dispositif de contrôle ont été choisis au hasard dans les mêmes maisons de soins infirmiers à l’aide d’un tableau de nombres aléatoires et ont été invités à participer. Pour évaluer la colonisation par S. aureus, des échantillons ont été prélevés sur des narines, oropharynx, site d’insertion du tube d’alimentation, aine, région périanale et plaies si présentes en utilisant des écouvillons avec dacron pour les groupes d’étude et de contrôle. et incubées à ° C pendant h colonies jaunes vives suggérant S aureus ont été cultivées sur agar trypticase soja avec% de sang de mouton et ont été confirmées être S aureus par coloration de Gram, positivité à la catalase et agglutination avec un test rapide pour la protéine A Les isolats ont été testés pour la résistance à la méthicilline par croissance sur agar Mueller-Hinton contenant de l’oxacilline, μg / mL, et% NaCl Un résident colonisé avec SARM et SASM a été classé comme porteur de SARM Un isolat SARM de chaque résident colonisé avec SARM a été dactylographié en utilisant Méthodes décrites ci-dessous Méthodes d’épidémiologie moléculaire L’électrophorèse en champ pulsé a été réalisée pour caractériser la parenté des isolats de MRSA. L’ADN génomique a été préparé et digéré. On a comparé les fragments SmaI en utilisant un appareil CHEF DR III BioRad et on les a comparés en utilisant le logiciel BioNumerics Applied Maths Tous les isolats de MRSA ont été comparés aux souches MRSA USA- Les isolats ont été placés dans le même groupe de souche PFGE si leur SmaI La PCR multiplexe a été réalisée pour caractériser la cassette staphylococcique chromosomique mec SCCmec types I-V Les souches non typables ont été analysées par ccr en utilisant la PCR avec des amorces. Nous avons également été intéressés par la fréquence de la colonisation extranasale par SARM et MSSA chez les résidents de maisons de retraite communautaires secondaire. le nombre de sites de colonisation avec ces organismes et l’impact des dispositifs à demeure sur la colonisation Toutes les données ont été saisies une base de données Excel Microsoft et analysée à l’aide du logiciel Stata, la version Stata Univariate analyses ont été effectuées pour examiner la propagation des données Les variables catégorielles ont été comparées en utilisant χ test P valeurs & lt; ont été considérés comme statistiquement significatifs

Résultats

Un total de résidents qui avaient un cathéter urinaire à demeure, un tube de gastrostomie percutanée ou un cathéter intraveineux central et des résidents choisis au hasard étaient admissibles à l’étude. Les résidents étaient des établissements de soins infirmiers qui contenaient un total de lits. Quarante-six résidents de l’étude avaient un cathéter urinaire seulement, avaient une sonde d’alimentation entérale seulement, avaient les deux, et les résidents avaient un cathéter intraveineux central seulement. ,% des résidents ont été colonisés par S aureus au site;; cela incluait le pourcentage de résidents dans le groupe de dispositifs et le pourcentage de résidents dans le groupe de contrôle OU; % CI, -; P & lt; Quatre-vingt-six résidents ont été colonisés avec SARM avec SARM seulement et avec SARM et SASM, et ont été colonisés avec SASM seul tableau Nares cultures étaient positifs pour SARM dans% des résidents qui ont été colonisés avec SARM Il n’y avait pas de différences dans les taux de colonisation nasale SASM entre le groupe et les groupes de contrôle, bien que le taux de colonisation de SARM était significativement plus élevé chez les résidents avec des dispositifs à demeure [%] de vs [%] de; OU, ; % CI, -; P & lt; La colonisation nasale avec SARM a été trouvée dans% des résidents avec des dispositifs et dans% de ceux sans dispositifs; la colonisation nasale avec MSSA a été trouvée en% des résidents de chaque groupe P = pas significatif Les résidents du groupe dispositif étaient significativement plus susceptibles d’être colonisés par SASM ou MRSA dans leur région aine et périanale que les résidents du groupe témoin.

Tableau View largeTéléchargerColonisation avec Staphylococcus aureus sensible à la méthicilline MSSA et S aureus résistant à la méthicilline MRSA chez les résidents de maisons de soins communautaires avec et sans dispositifs à demeureTable View largeTéléchargementColonisation avec Staphylococcus aureus sensible à la méthicilline MSSA et S aureus résistant à la méthicilline MRSA chez les résidents des foyers de soins communautaires avec et sans dispositifs à demeure Parmi les résidents qui ont été trouvés colonisés sur le site seulement, les nares seuls ont été colonisés dans% des résidents colonisés par SARM et dans% des colonisés avec SASM Parmi les résidents qui ont eu SARM trouvé seulement sur un seul site ,% ont été colonisés dans l’oropharynx,% ont été colonisés dans l’aine ou la région périanale, et% ont été colonisés sur le site de gastrostomie percutanée.En général,% des résidents des foyers de soins colonisés par MSSA seuls ont été colonisés sur ⩾ sites, et% des colonisés avec SARM ont été colonisés à ⩾ sites figure Le groupe d’appareils était plus susceptible d’être colonisé sur plusieurs sites que ceux du groupe témoin. Par exemple, tous les résidents ayant une colonisation par le SARM sur les sites had avaient une table d’appareils à demeure.

Figure Vue largeTélécharger Diapositive Fréquence de la colonisation sur plusieurs sites avec Staphylococcus aureus MSSA sensible à la méthicilline et S aureus résistant à la méthicilline MRSA chez les résidents des maisons de repos communautairesFigure Voir grandTélécharger DiapositiveFréquence de colonisation à plusieurs sites avec Staphylococcus aureus sensible à la méthicilline SASM et S aureus résistant à la méthicilline MRSA parmi les résidents des foyers de soins communautaires

Tableau View largeTélécharger diapositives Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline Modèles de colonisation à SARM chez les résidents des foyers de soinsTable View largeTélécharger diapositive Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline Modèles de colonisation SARM chez les résidents des foyers de soinsPFGE a été réalisée sur des isolats récupérés chez chacun des résidents atteints de MRSA. PFGE chez ces résidents Les souches représentatives sont montrées dans la figure Chaque établissement de soins infirmiers avait – différents types de PFGE en circulation Soixante-treize pour cent des résidents ont été colonisés par SCCmec II, qui est généralement associé à l’hôpital; ceux-ci comprenaient des isolats américains, des isolats américains et des isolats appartenant à des groupes PFGE autres que les États-Unis. Tous les isolats de SCCmec II étaient négatifs pour la PVL, et la plupart étaient agr II

Figure Vue largeDownload dendrogramme montrant une parenté génétique entre des souches représentatives de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline MRSA récupérées chez des résidents de maisons de retraite communautaires Des résidents colonisés avec SARM, ont été colonisés avec SCCmec II, colonisés avec SCCmec IV et colonisés avec mecA, ccr PVD, Panton-Valentine leucocidinFigure Voir grandDownload dendrogramme basé sur la génétique montrant la parenté génétique parmi les souches résistantes à la méthicilline Staphylococcus aureus SARM récupérées chez les résidents des maisons de repos communautaires Des résidents colonisés par SARM, ont été colonisés par SCCmec II, colonisés par SCCmec IV, et ont été colonisé par mecA, ccr PVL, leucocidine de Panton-Valentine% des résidents du groupe dispositif et du groupe témoin ont été colonisés par SARM contenant SCCmec IV, qui est maintenant de plus en plus souvent décrit comme un SARM-CA. Ces souches ont été isolées chez les résidents , la zone périanale dans, le o ropharynx dans, et un site de tube de gastrostomie percutanée placé dans Deux de ces souches ont contenu PVL: un était USA, SCC mec IV, agr I; et l’autre était USA, SCC mec IVa, agr III Parmi les isolats SCC mec IV restants, étaient USA, USA et étaient des souches uniques Cinq résidents ont été colonisés avec mecA ccr souches Figure

Discussion

Nos données montrent que la colonisation extranasale par MSSA et MRSA est courante chez les résidents des foyers de soins. Un tiers des soins infirmiers communautaires Les résidents qui ont été colonisés par SARM auraient été oubliés si la collecte d’échantillons sur écouvillon avait été limitée aux narines seulement. L’oropharynx était souvent le seul site colonisé, comme l’ont noté d’autres personnes ayant étudié les patients hospitalisés et les patients externes Des études menées dans des établissements de soins actifs ont révélé que% -% des patients colonisés ne seraient détectés que si plusieurs sites étaient échantillonnés au moment de l’hospitalisation Une étude prospective de patients en unité de soins intensifs ayant subi un dépistage bi- hebdomadaire du SARM. Le transport a révélé que plus de% des personnes colonisées par SARM n’avaient pas de portage nasal , et une autre étude sur des patients âgés hospitalisés a noté que% des porteurs de SARM auraient été oubliés si seulement les narines avaient été échantillonnées Identifier un groupe de personnes à haut risque de colonisation extranasale pourrait aider à cibler les ressources de laboratoire et cliniques. Cependant, les données sur ce qui constitue une population à haut risque pour extranasale. la colonisation par le SARM fait défaut Notre étude aide à définir un groupe qui semble être à risque de colonisation extranasale; % des résidents du groupe de dispositifs ont été colonisés avec SARM seulement dans leurs régions aine et périanale, et% ont été colonisés seulement dans l’oropharynx. Les patients avec des dispositifs à demeure étaient également plus susceptibles d’être colonisés à plusieurs sites. L’infection par SARM-CA est devenue un problème majeur, se présentant souvent comme une infection sévère et récurrente de la peau et des tissus mous en général. Les résidents sont colonisés par des SARM d’hôpital, généralement SCC mec II Cependant, des rapports de SARM-CA dans les maisons de retraite émergent lentement À San Francisco, Californie,% des isolats cliniques CA-MRSA provenaient de maisons de retraite Des infections dues à SCCmec V MRSA ont été notées chez des résidents d’un foyer de soins en Finlande , et une autre maison de retraite en Allemagne a rapporté que% des résidents étaient colonisés par P Souches de SARM à VL Une étude des résidents des établissements de soins résidentiels et continus de Hong Kong a noté que% étaient colonisés par des souches SCC mec IV ou V MRSA Dans notre étude, les résidents colonisés par SARM% étaient colonisés par des souches SCCmec IV L’émergence de ces souches dans ce contexte modifiera vraisemblablement la sélection des traitements antibiotiques empiriques pour les infections de la peau et des tissus mous et pourrait ouvrir la porte à de nouvelles infections. La force majeure de cette étude – qui la rend généralisable – est qu’elle met l’accent sur les résidents de plusieurs foyers de soins communautaires. La plupart des études antérieures sur la colonisation par le SARM et d’autres organismes pharmacorésistants été menée dans les installations d’Anciens Combattants Canada; par conséquent, on ne savait pas dans quelle mesure les résultats étaient applicables aux foyers de soins communautaires, qui s’occupent de la majorité des personnes âgées nécessitant des soins de longue durée. [,,] Notre étude comporte quelques limites La conception transversale de l’étude ne permet pas de déterminer une relation temporelle entre la colonisation extranasale par SARM et la présence de dispositifs à demeure et ne permet pas d’évaluer la durée de la colonisation à divers sites corporels. En outre, il ne s’agissait pas d’une enquête de prévalence de tous les résidents des maisons de soins infirmiers. Dans quelle mesure la colonisation par le SARM-CA se produit-elle chez les résidents des foyers de soins communautaires du sud-est du Michigan, mais ne peut que soulever l’émergence de cet organisme comme une préoccupation dans le contexte des soins de longue durée

Remerciements

Soutien financier Prix de développement de carrière axé sur le patient de l’Institut national du vieillissement, bourse d’études ASP / AGS T Franklin Williams et programme d’examen du mérite d’Anciens Combattants Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: aucun conflit