Staphylococcus aureus Carriage oropharyngé dans une population carcérale

% De transport de la gorge de Staphylococcus aureus a dépassé le transport nasal% dans les prisons de New York La résistance à la méthicilline, principalement due aux États-Unis, était élevée dans les deux sites; % des détenus doublement colonisés avaient des souches différentes Les stratégies pour réduire la transmission de S aureus devront tenir compte de la fréquence élevée de la colonisation de la gorge

Des études récentes ont identifié l’oropharynx comme un site potentiel de colonisation de Staphylococcus aureus Cette colonisation peut se produire en présence ou non de colonisation nasale Le transport oropharyngien de S aureus a des ramifications potentiellement importantes dans les stratégies de décolonisation des populations à haut risque infectieux. Dans un rapport antérieur, nous avons trouvé un taux élevé de portage de MRSA S aureus résistant à la méthicilline dans les prisons de New York Dans le cadre d’une enquête sur l’infection à S. aureus dans la population carcérale, des échantillons prélevés par écouvillonnage nasal et oropharyngien ont été prélevés chez des détenus de Sing Sing et des femmes de Bedford Hills, à New York. caractériser la nature du transport de S aureus et déterminer si les carrioles oropharyngées L’Institutional Review Board de l’Université Columbia et le Département des services correctionnels de l’État de New York ont ​​examiné et approuvé cette étude. Dans les deux établissements, l’administration pénitentiaire a fourni une Liste des prisonniers entrant dans l’établissement cette semaine-là Ces détenus, situés dans la zone d’attente, ont été priés en privé s’ils souhaitaient participer et, s’ils étaient d’accord avec Sing Sing et% chez Bedford Hills, ont donné leur consentement éclairé. Becton Dickinson Les données recueillies comprenaient des caractéristiques démographiques et des antécédents personnels, tels que l’origine ethnique, le temps passé dans le système carcéral, les antécédents médicaux et les antécédents de vie. conditions Cette information a ensuite été vérifiée par l’examen des dossiers médicaux officiels des prisons Eac h L’échantillon a été incubé dans du bouillon de soja trypsique supplémenté de chlorure de sodium Becton Dickinson à ° C pendant une nuit, pour enrichir la sélection de S aureus avant d’être étalé sur agar Becton Dickinson et incubé à ° C pour h mélanome. plaques de gélose au sang avant d’être confirmées comme S aureus avec le kit de détection coagulase et protéine A Murex StaphAurex Les échantillons positifs ont été typés et comparés avec le logiciel Ridom Staph Type Ridom GmbH Les isolats résistants à la méthicilline sont des staphylocoques test de réaction en chaîne de la polymérase, tel que décrit ailleurs Paramètres du modèle basé sur les répétitions BURP dans le logiciel Ridom StaphType, en utilisant des étalons déterminés par Mellman et al , ont été utilisés pour caractériser davantage les isolats. et la gorge qui ont été identifiés comme distincts ont été examinés en utilisant l’électrophorèse sur gel à champ pulsé PFGE avec SmaI digest pour confirmer qu’ils étaient différents Les paramètres pour PFGE étaient les suivants: temps de commutation initial, s; temps de commutation final, s; angle inclus, °; courant, V; La température du tampon a été maintenue à ° C Les souches ont été comparées en utilisant le coefficient Dice avec un taux de similarité de% pour identifier les souches étroitement apparentées Bionumerics et les critères Tenover pour examiner le nombre de différences de bande entre les souches appariées La majorité des participants à Sing Sing se décrivaient eux-mêmes comme étant noirs% ou Latino / Hispaniques% La grande majorité était déjà dans le système carcéral et a été transférée d’autres prisons pour des raisons administratives ou de placement dans une nouvelle installation. En comparaison avec les détenus de Sing Sing, ils étaient plus susceptibles d’être transférés du système de détention% Ainsi, les groupes de détenus reflétaient différentes étapes de l’incarcération Il n’y avait pas de différences identifiables dans les données sociodémographiques, y compris l’âge, l’origine ethnique et les résidences antérieures, lorsque les taux de colonisation de S aureus ont été comparés dans les prisons

Tableau Description des détenus et des échantillons recueillis dans les prisons Bedford Hills n = Sing-Sing n = Caractéristique Ethnicité Proportion positive pour Staphylococcus aureus% Proportion positive pour S aureus% Noir / / Blanc / / Latino / Hispanique / / Autre / / Résidence avant la prison Prison différente ou identique Autre maison, appartement, etc. Sites d’échantillonnage positifs pour S aureus Total des individus colonisés aux narines, à la gorge ou aux deux sites / / Nares / / Gorge / / Individus colonisés aux narines et aux throates / / Même type de spa Type de station thermale Différents échantillons de S aureus positifs au SARM de type spa Proportion positive pour MRSAb% Proportion positive pour MRSAb% Nombre total d’individus colonisés aux narines ou à la gorge / / Nasale / / Gorge / / SCCmec typesc SCCmec I, II et III SCCmec IV & amp; V Non typable Types de spa les plus répandus dans les prisons type MSSA *, MRSA MSSA, SARM type t / eGenomics MSSA, SARM MSSA, SARM type t / eGenomics SASM SASM, SARM Bedford Hills n = Sing-Sing n = Ethnicité caractéristique Proportion positive pour Staphylococcus aureus% Proportion positive pour S aureus% Noir / / Blanc / / Latino / Hispanique / / Autre / / Résidence avant la prison Prison différente ou identique Prison Autre maison, appartement, etc. Sites d’échantillonnage positifs pour S aureus Total des individus colonisé au niveau des narines, de la gorge ou des deux sites / / Nare / / Gorge / / Individus colonisés aux deux narines et throata / / Même type spa Type de spa similaire Différents échantillons de S aureus positifs au SARM de type spa Proportion positive pour MRSAb% Proportion positif pour MRSAb% Total ind individus colonisés au niveau des narines ou de la gorge / / Nasale / / Gorge / / SCCmec typesc SCCmec I, II et III SCCmec IV & amp; V non typables Les types de spa les plus répandus dans les prisons type MSSA *, MRSA MSSA, SARM type t / eGenomics MSSA, MRSA MSSA, SARM type t / eGenomics MSSA MSSA, MRSA aMSSA, Staphylococcus aureus sensible à la méthicilline; SARM, Staphylococcus aureusbDual colonisation résistant à la méthicilline indique une différence dans le type spa de la souche isolée du nasale par rapport à l’oropharynx d’une seule cassette chromosomique inmatecStaphylococcal SCC types mecView LargeSamples de femmes et d’hommes ont été recueillis pendant une période de mois de Novembre à Juin, avec & gt;% de tests positifs Il y avait des échantillons nasaux et oropharyngés positifs pour S aureus Le taux global de portage dans la gorge [%] dépassait celui des narines antérieures [%] de; P & lt; Les femmes de Bedford Hills présentaient un taux combiné de colonisation nasale et oropharyngée inférieur à celui des hommes à Sing Sing P = S aureus sensible à la méthicilline MSSA oropharyngée% Bedford Hills et% Sing Sing versus nasale% Bedford Hills et% Sing Sing les installations étaient comparables P & gt; Cinquante-neuf pour cent des participants de notre groupe d’étude ont été colonisés avec SARM à l’un ou l’autre ou les deux sites nasaux et oropharyngés Tableau Le taux de portage de SARM était similaire à la fois dans les échantillons nasaux et de la gorge% nasale et% oropharyngée à Bedford Hills; % nasale et% oropharyngée chez Sing Sing Dix hommes et femmes ont été colonisés par SARM uniquement dans l’oropharynx. Cent quarante-sept types de spas différents ont été identifiés. Le type épidémique USA type spa t / eGenomics était le plus répandu, représentant% du des échantillons positifs, avec des de ces isolats étant sensibles à la méthicilline USA et des souches étroitement liées aux USA comme défini par l’analyse BURP des types de spa représentaient% de tous les échantillons positifs, encore avec des taux de colonisation nasale et oropharyngée similaires% nasale et% oropharyngée à Bedford Hills; % des cas nasaux et% oropharyngiens à Sing-SingA surprenant% des individus testés positifs aux sites nasaux et oropharyngés présentaient des souches différentes, telles que définies par leurs types de spas, et ont été classés comme colonisés par voie orale Parmi ces personnes étaient des personnes colonisées par MSSA et SARM à les sites Les échantillons de ces détenus ont été comparés à l’aide des programmes de comparaison et de regroupement à répétition Ridom Staph Type pour déterminer si les isolats étaient liés Cinq individus avec différents types de spas ont été colonisés avec des types de spas apparentés selon le regroupement BURP Six pour cent des individus doublement colonisés aussi SARM positif Tous les isolats nasaux et oropharyngés appariés identifiés comme différents par typage spa n = ont été confirmés comme étant uniques avec l’utilisation d’une technique de typage séparée, PFGE Figure

Figure Vue largeTélécharger la diapositive Cinq échantillons représentatifs de détenus bi-colonisés qui ont été choisis pour montrer les différences dans les paires d’isolats de Staphylococcus aureus Les types de spa indiquent l’affectation du type de déformation basée sur le logiciel Ridom L’attribution du profil allélique différent répète et leur emplacement pour le Les profils PFGE de la paire discordante sont également affichés avec le dendrogramme affichant le degré de similarité des souches. Les scores de similarité par paire pour les isolats ont été calculés en utilisant le coefficient de DiceFigure View largeTélécharger la diapositiveDos échantillons représentatifs de détenus bi-colonisés choisi pour montrer les différences dans les paires d’isolats de Staphylococcus aureus Les types de spa indiquent l’affectation du type de souche basé sur le logiciel Ridom L’attribution du profil allélique des répétitions différentes et leur localisation pour les types de spa est également fournie. sont aussi o affiché avec le dendrogramme montrant le degré de similarité des souches Les scores de similarité par paire pour les isolats ont été calculés en utilisant le coefficient de DiceCette étude a montré un port continu élevé de S aureus, en particulier le portage SARM, dans cette population connue pour être à haut risque de S aureus Les nouveaux détenus, principalement transférés des prisons de Bedford Hills, et les prisonniers transférés d’autres établissements correctionnels de l’État de New York Sing Sing avaient des taux élevés de portage Des souches communautaires nouvelles ou répandues semblent être régulièrement introduits dans ces établissements par les détenus arrivant de la communauté ou des prisons locales Une fois introduites, les souches peuvent persister et / ou être transmises à d’autres détenus en milieu carcéral. Le transfert des détenus entre les différentes prisons, qui se produit régulièrement , peuvent contribuer à leur propagation comme dans notre précédent rapport, l’épidémie La souche mic t / eGenomics USA était la souche la plus répandue dans les isolats de MSSA et de SARM, suggérant qu’elle est facilement disséminée en milieu carcéral Compte tenu de sa virulence potentielle, la base de l’introduction et de la propagation de cette souche dans la le système pénitentiaire est important. Nos résultats montrant une augmentation de la gorge par rapport au nasal de S aureus confirment également que l’oropharynx est un réservoir important de S aureus. Il n’y avait pas de différence statistiquement significative dans les taux de colonisation des sites d’infection à SARM. pas toujours le cas, car d’autres chercheurs ont spéculé que, dans certains milieux comme les unités de soins intensifs, la colonisation de l’oropharynx par le SARM peut être moins fréquente Enfin, l’observation que des individus peuvent être colonisés simultanément par différentes souches de S aureus est d’un intérêt considérable Nilsson et Ripa ont noté que des participants colonisés par différentes souches avaient Plus récemment, Hamdan-Partida et al , en plus de déclarer une colonisation de la gorge plus élevée que la nare dans une population de porteurs sains au Mexique, ont trouvé qu’un petit pourcentage de participants à l’étude doublement colonisés présentaient des souches différentes dans leurs narines. gorge Dans la présente étude, il y avait un taux relativement élevé de détenus doublement colonisés avec différentes souches, ce qui suggère que ce type de colonisation pourrait être plus fréquent qu’on ne le pensait, au moins dans les populations à risque élevé d’infection. Le rôle de la colonisation oropharyngée comme réservoir potentiel d’infection future demeure incertain Sa fréquence en tant que site de colonisation soulève des questions concernant l’efficacité de thérapies topiques telles que la mupirocine ou la chlorhexidine en tant que schémas prophylactiques. Le fait qu’une minorité significative d’individus peut être colonisé avec différentes souches ayant une fourmi différente La susceptibilité ibiotique, comme les personnes colonisées par des isolats de SASM et SARM, est également préoccupante. Des études futures devront aborder ces questions dans les essais cliniques. Nous remercions Rachel Gordon, Anne-Catrin Uhlemann, Andrew J Lee, surintendant Philip Heath, surintendant Sabina Kaplan, Surintendant adjoint Marjorie Byrnes, Surintendant adjoint Kevin Winship, Surintendant adjoint Michael Capra, Dr Maryann Genovese, Dr Lori Goldstein, Dr Denise Sepe, Dr Dana Gage, Bani Choudry, Margaret Franklin, Randi Uszak, Jon Hansen et Francis AkinyomboAide financière Ce travail a été soutenu par l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses, National Institutes of Health R AIPotential conflits d’intérêts Tous les auteurs: pas de conflits