Variations des infections invasives à Salmonella par taille de population dans la municipalité Asante Akim North, Ghana

Contexte Le Programme de surveillance de la fièvre typhoïde en Afrique TSAP a estimé les taux d’incidence ajustés IR pour Salmonella enterica sérovar Typhi et les sérovars S enterica non-invasifs envahissants iNTS de & gt; cas par personne-années d’observation PYO pour les enfants âgés de & lt; années à Asante Akim Nord Municipal AAN, Ghana, entre Mars et Mai Nous avons analysé combien ces taux différaient entre les milieux ruraux et urbains Méthodes Les enfants recrutés à l’hôpital presbytérien Agogo et répondant aux critères d’inclusion TSAP ont été inclus dans les villes d’analyse avec & gt; les habitants étaient considérés comme urbains; villes avec des populations & lt; ont été considérés comme ruraux Les IR ajustés pour les infections de la circulation sanguine causées par Salmonella ont été estimés pour les deux paramètres Taux d’incidence normalisés selon l’âge et spécifiques au cadre pour les enfants âgés de moins de 18 ans. des années ont été dérivées et utilisées pour calculer les rapports de taux normalisés selon l’âge. SRT pour évaluer les différences entre les paramètres. Résultats Quatre-vingt-huit pour cent des patients recrutés répondaient aux critères d’inclusion et ont été analysés IR des infections sanguines à Salmonella chez les enfants. ans étaient & gt; par PYO dans les deux contextes Parmi les enfants des zones rurales, les taux de Salmonella Typhi et d’iNTS étaient plusieurs fois SRR; % intervalle de confiance [IC], – et presque fois SRR,; % CI, – plus élevé, respectivement, que les taux chez les enfants des villes Conclusions IR des infections sanguines par Salmonella chez les enfants & lt; ans dans AAN, Ghana, différait par le cadre, avec des taux presque à des niveaux plus élevés dans le cadre moins peuplé Les variations dans la distribution de la maladie devraient être considérées pour mettre en œuvre de futures études et stratégies d’intervention

Salmonella, rates, urban, rural, Ghana Infections sanguines Les bactériémies causées par Salmonella enterica sérovar Typhi et les sérovars S entica non-invasifs S entica sont des causes importantes de maladie fébrile chez les enfants en Afrique subsaharienne Les infections à Salmonella Typhi sont fréquemment signalées dans les zones très peuplées. zones où l’infrastructure de l’eau et de l’assainissement est limitée, alors que les infections INN sont fréquentes dans les populations où le VIH, la malnutrition et la prévalence du paludisme sont élevés Comprendre l’épidémiologie des bactériémies à Salmonella, y compris les variations de distribution de la maladie. Le Programme de surveillance de la typhoïde en Afrique (PATS) a rapporté des taux d’incidence des bactériémies à Salmonella provenant de divers sites en Afrique subsaharienne. Marks et von Kalckreuth, données inédites & gt; par personne-années d’observation PYO chez les enfants âgés de & lt; Nous avons évalué les taux d’incidence des bactériémies à Salmonella estimées pour les zones urbaines et rurales dans les régions AAN et Asan Akim Nord, dans la région d’Ashanti, au Ghana.

Méthodes

Site d’étude

L’étude a été menée dans l’AAN, région d’Ashanti, Ghana, entre mars et mai. Il est important de noter que les frontières d’AAN ont été redessinées en juin et les districts ont été créés Asante Akim North et Central District selon le recensement de la population et du logement le Ghana Statistical Service, AAN avait une population totale d’habitants répartis dans les communautés ou les villes dans une zone de km Des villes, ont été inclus dans le bassin versant basé sur les données disponibles sur les modèles d’utilisation des soins de santé Les plus grandes villes de la région sont Agogo et Konongo-Odumasi, avec des populations allant des capitales et des capitales des nouveaux districts Asante Akim North et Central District Hotels, bureaux de poste, banques, marchés principaux, hôpitaux et établissements d’enseignement supérieur et secondaire sont concentrés dans ces villes. Les autres villes et villages ont des populations allant des habitants aux Les services et les infrastructures licites Compte tenu de la taille de la population et des informations sur l’accès aux services publics et aux infrastructures publiées dans le recensement de la population et du logement, les villes ont été classées urbaines ou rurales. Les autres villes sont considérées comme rurales Le recensement de la population et du logement utilise un seuil d’habitants pour définir les villes urbaines ou rurales Ce seuil s’applique aux données de population actuelles à l’exception de la ville, Patriensa, avec une population d’habitants. les services publics et les infrastructures, cette ville était considérée comme rurale Les caractéristiques des conditions de vie dans les zones urbaines et rurales sont résumées dans le tableau

Tableau Caractéristiques des Ménages Situés en Milieu Urbain et Rural à Asante Akim Nord Municipalité a Caractéristique Urbain,% Non Rural,% Non Mur Matériau Brique de boue / terre Bois Bloc de ciment / béton Autre Source d’éclairage Électricité dans la maison Lampe de poche / torche Lampe au kérosène Autres Installations d’eau potable Installation à l’intérieur des conduites Installation extérieure sur tuyauterie Trou à l’extérieur / pompe / puits Robinetterie publique Eau à robinet Protégé Autres WC Toilettes WC latrines KVIP Toilettes publiques b Autres Aucune installation buisson / champ Caractéristique Urbain,% Non Rural, % Non Matériau du mur Brique de terre / terre Bois Cement de maçonnerie / béton Autre Source d’éclairage Électricité à la maison Lampe de poche / torche Keros lampe ene Autres Installations d’eau potable Réservoir à l’intérieur des habitations Conduite à l’extérieur Conduite alésage / pompe / puits Robinetterie publique Eau à clapet Puits protégé Autres Toilettes W.-C. WC à latrines KVIP Toilettes publiques b Autres Pas d’installation buisson / champ Source: Adapté de Recensement de la population et de l’habitat Abréviation: KVIP, Kumasi ventilé amélioré latrines ménages interviewés lors du recensement de la population et du logement de toutes les villes situées dans Asante Akim Nord Municipal b Comprend un water-closet, KVIP, latrine à fosse, seau, etc.

Figure Vue largeTélécharger le diaporamaCarte de la zone d’étude, Asante Akim Nord Municipal, GhanaFigure Vue largeTélécharger le diaporamaCarte de la zone d’étude, Asante Akim Nord Municipal, Ghana Au total, les communautés urbaines avaient une population d’habitants% age & lt; années et les communautés rurales avaient une population d’habitants% & lt; années Ces populations ont été utilisées pour estimer les RI spécifiques au milieu. Il s’agit de la première tentative de décrire l’incidence des infections invasives à Salmonella stratifiées par milieu urbain et rural dans cette zone d’étude.

Recrutement

Les patients ont été recrutés à l’hôpital presbytérien Agogo pendant les jours de semaine suivant l’inclusion des PATS et les procédures de recrutement standard Enfants âgés de & lt; les années provenant de l’une des villes avec des températures tympaniques / axillaires ≥ ≥ ° C / ° C ou avec des antécédents de fièvre au cours des dernières heures étaient éligibles à l’hospitalisation Après obtention du consentement éclairé, le personnel formé a enregistré les antécédents médicaux et les données d’examen physique dans des formes d’étude standardisées, et des échantillons de sang – mL; échantillon par patient ont été recueillies

Procédures de laboratoire

Du sang a été inoculé dans des flacons d’hémoculture aérobie BC BACTEC PEDS PLUS / F Medium; Becton, Dickinson et Co, Sparks, Maryland et incubés dans un système de culture de sang coloration de Gram, sous-culture sur des milieux standard, et identification de microorganisme ont été effectuées pour toutes les hémocultures positives souches de référence American Type Culture Collection [ATCC], Manassas, Virginia en tant que témoins Les bactéries de la flore cutanée normale, par exemple, les staphylocoques à coagulase négative et les espèces de Micrococcus et les micro-organismes environnementaux typiques, par exemple les espèces de Bacillus, ont été définies comme des contaminants.

Approbation éthique

L’étude a été approuvée par l’Institutional Review Board de l’International Vaccine Institute, République de Corée, et par le Comité de la recherche humaine, publications et éthique, School of Medical Science, Université des Sciences et Technologies Kwame Nkrumah, Kumasi, Ghana. a été donné par les parents ou les tuteurs des enfants inscrits

Gestion des données, définition des variables et analyse

Le test de Pearson a été utilisé pour évaluer les différences dans les proportions de variables démographiques et de laboratoire entre les milieux ruraux et urbains. Les variables démographiques incluaient l’âge stratifié en groupes et le sexe féminin; variable de laboratoire inclus hémocultures positives Les hémocultures contaminées ont été exclues de l’analyse Les RI de Salmonella BSI ont été calculés pour les milieux urbains et ruraux dans les groupes stratifiés selon l’âge des nourrissons, – année; enfants d’âge préscolaire, – années; Un sondage sur l’utilisation des soins de santé, administré à un échantillon aléatoire représentatif de ménages dans chacune des villes, a déterminé la proportion de la population étudiée consultant les établissements de santé en cas de fièvre Cette proportion spécifique à la ville a été appliquée La population ajustée combinée de chaque milieu rural et urbain a été utilisée pour estimer le PYO pour les IR Pour calculer le PYO, un taux de croissance annuel de% de la région Ashanti a été appliqué à la population. population ajustée spécifique au milieu pour estimer la population à la fin de la période de surveillance Ensuite, les populations ajustées au début et à la fin de la période de surveillance ont été moyennées et multipliées par le nombre total d’observations observées dans les villes urbaines et non urbaines. période de surveillance mensuelle ont été ajoutées pour créer les cas spécifiques au contexte. Ces cas spécifiques corrigé pour le nombre de jours de recrutement / et la proportion d’enfants recrutés parmi tous les enfants se présentant à l’hôpital et répondant aux critères d’inclusion: pour les enfants âgés de & lt; ans et pour les enfants d’âge ans Les intervalles de confiance Les IC ont été calculés en utilisant un facteur d’erreur EF = exp [/ √ajustements ajustés] pour un taux plus faible% CI: taux ajusté / EF -% supérieur CI: taux ajusté × EF S Les taux de Typhi et d’iNTS entre les milieux ruraux et urbains, les taux normalisés selon l’âge et spécifiques au milieu ont été calculés pour les enfants âgés de moins de 18 ans. L’erreur standard ASR spécifique au milieu a été utilisée pour calculer le% IC. Le ratio tarifaire standardisé SRR a été calculé en utilisant l’ASR du milieu rural et urbain SRR a été utilisé pour évaluer les différences entre les deux. taux d’incidence pour les milieux ruraux et urbains Toutes les analyses statistiques ont été effectuées en version SAS, SAS Institute

RÉSULTATS

Pendant la période de surveillance, les enfants ont été recrutés et% d’entre eux ont été exclus de l’analyse pour ne pas avoir satisfait aux critères d’inclusion des études. Les enfants étaient inclus dans l’analyse, le% rural et le milieu urbain. les deux paramètres Tableau, et le pourcentage de patients féminins était de% / et% / dans les zones rurales et urbaines, respectivement

Données démographiques et résultats de laboratoire des patients recrutés à l’hôpital presbytérien Agogo dans les milieux ruraux et urbains, mars – Milieu rural, non% urbain, non% P Valeur Démographie Âge, âge médian, quartile mo, y y, y & gt; Patients recrutés, par groupe d’âge n = n = – y & lt; – y – y & lt; Sexe, sexe féminin, par groupe d’âge n = n = – y – y – y Résultats de laboratoire n = vn = Infections sanguines Salmonella enterica sérovarses INBS Salmonella Typhi Milieu rural, Non% Urbain, Non% P Valeur Démographie Âge, médiane e, quartile mo, y y, y & gt; Patients recrutés, par groupe d’âge n = n = – y & lt; – y – y & lt; Sexe, sexe féminin, par groupe d’âge n = n = – y – y – y Résultats de laboratoire n = vn = Infections sanguines Salmonella enterica sérotypes iNTS Salmonella Typhi Abréviation: iNTS, salmonelle invasive non salmonelleuse View Large La fréquence des bactériémies était plus élevée en milieu rural P = Salmonella enterica représentait la majorité des bactériémies sur les deux sites, avec des différences significatives entre eux:% / et% / en milieu rural et urbain, respectivement P Sur les sérotypes de la sous – espèce S enterica, les sérovars INN ont été les plus fréquents dans les deux sites. Les isolats de Salmonella Typhi ont été identifiés en% / et% / de BSI en milieu rural et urbain P =; Tableau Les RI de tous les bactériémies à Salmonella chez les enfants & lt; ans étaient & gt; En milieu rural, les enfants d’âge préscolaire présentaient les taux d’IR S Typhi les plus élevés, [% IC, -] et les taux d’incidence de l’INBS, [% IC, -] le taux d’incidence S Typhi IR, [% CI, -] était le plus élevé chez les enfants d’âge préscolaire, et le taux d’iNTS IR, [% CI, -] était le plus élevé chez les nourrissons. ; ans était presque plus élevé SRR, [% CI, -] que le ASR iNTS chez les enfants urbains De même, le SRAS S Typhi chez les enfants ruraux était SRR fois plus élevé, [% CI, -] que le S Typhi ASR chez les enfants urbains

Tableau et Salmonella typhi ajusté en fonction de l’âge et taux d’incidence de Salmonella invasive non-salmonellaire dans Asante Akim North Municipal, Ghana, agrégé sur la période Mars – Mai Âge, y Estimation PYO Salmonella Typhi Etude d’établissement d’une population non ajustée b Population non ajustée moyenne Population, No C PYO d Cas ajustés Cas brut Cas f Taux d’incidence ajusté par PYO% Cas ajustés e Cas bruts f Taux d’incidence ajusté par PYO% CI – Rural – – Urbain – – – Rural – – Urbain – – – Rural – – Urbain – – & lt; Rural – – Urbain – – Âge, y Estimation PYO Salmonella Typhi Etude d’établissement d’une population non ajustée b Population non ajustée moyenne Population non ajustée PYO d Cas ajustés Cas bruts f Taux d’incidence ajusté par PYO% CI ajustés Crude Cas f Taux d’incidence ajusté par PYO% CI – Rural – – Urbain – – – Rural – – Urbain – – – Rural – – Urbain – – & lt; Rural – – Urbain – – Abréviations: IC, intervalle de confiance; SNTS, Salmonella non-invasive envahissante; PYO, personne-années d’observation a Population publiée par le recensement d’Asante Akim North Municipal b Proportion d’utilisation des soins de santé appliquée à chaque ville incluse dans la population d’étude publiée par le recensement c Population ajustée au début et à la fin de la période de surveillance moyenne population ajustée multipliée par les années d’observation e Cas ajustés pour la proportion de patients éligibles recrutés f Cas identifiés pendant les mois de surveillance View Large

Tableau Salmonella Typhi et Salmonella invasive non salmonelleuse Taux d’incidence normalisés selon l’âge pour les milieux ruraux et urbains et taux standardisés Taux caractéristiques de la population Cas prévus si S Typhi Taux d’incidence ajustés Cas prévus si iNTS Taux d’incidence ajustés Âge, y – Rural Urbain – Rural Urbain Rural Urban & lt; ASR urbain rural chez les enfants & lt; par PYO% CI Rural – – Urbain – – SRR chez les enfants & lt; PYO% IC – – Population caractéristique type Définition des cas prévus si S Typhi Taux d’incidence ajustés Cas prévus si les taux d’incidence ajustés iNTS Âge, y – Rural Urbain – Rural Urbain – Rural Urbain & lt; ASR urbain rural chez les enfants & lt; par PYO% CI Rural – – Urbain – – SRR chez les enfants & lt; par PYO% CI – – Abréviations: ASR, taux normalisé selon l’âge; CI, intervalle de confiance; SNTS, Salmonella non-invasive envahissante; PYO, personne-années d’observation; SRR, ratio de taux standardisé View Large

DISCUSSION

Les RI de Salmonella BSIs estimés pour le milieu rural et urbain chez les enfants âgés de & lt; années à AAN, Ghana, étaient & gt; Des cas similaires par PYO ont été rapportés par TSAP pour S Typhi IR, [% CI, -] et iNTS IR, [% CI, -] Néanmoins, lorsque les ASR spécifiques au milieu ont été comparés, les enfants vivant dans les zones rurales Les résultats révèlent un risque plus élevé pour le milieu rural qui n’était pas évident dans les taux non stratifiés estimés dans les PATS, ou par des études antérieures dans la même région [ ,] Ces résultats sont importants pour différentes raisons Premièrement, ils démontrent que les taux d’infections à Salmonella pourraient être significativement différents pour les enfants vivant dans la même région mais dans des contextes distincts. Deuxièmement, et contrairement aux rapports précédents , ils montrent des taux élevés trouvé pour les milieux considérés comme ruraux ou moins peuplés Récemment, une autre étude au Ghana évaluant l’association entre la bactériémie et l’urbanité a trouvé des résultats similaires et rapporté une association négative, en particulier pour les SNiT Une telle information est importante car elle contribuera éventuellement au développement de stratégies de prévention ainsi qu’à de futures études. La fréquence élevée de S Typhi comme cause commune des bactériémies dans cette zone d’endémie palustre est un autre résultat digne d’être mentionné. Des études en provenance d’Afrique subsaharienne ont rarement rapporté des isolats S Typhi provenant de zones à forte prévalence de paludisme [,,] Pendant la période de surveillance, les deux études ont été isolées par S Typhi. agent pathogène isolé fréquent après INBS et Streptococcus pneumoniae en milieu urbain et le deuxième agent pathogène isolé le plus fréquent après INBS dans le milieu rural Le nombre élevé d’enfants infectés par S Typhi dans le milieu rural pourrait s’expliquer par un accès plus pauvre à des installations sanitaires améliorées. sources d’eau potable sûres L’exposition à des sources d’eau non améliorées a déjà été associée à un% IC, Le paludisme, fréquemment rapporté comme facteur de risque de l’iNTS , était très prévalent dans la zone d’étude La recherche a montré que les individus sont plus sensibles à l’infection INNS et à l’anémie en développement pendant et après une infection palustre Dans cette population étudiée,% / des enfants infectés par l’iNTS ont été co-infectés par le paludisme et le paludisme est décrit dans l’article de Park et al, ce supplément représentait% / de toutes les infections bactériennes invasives co-infectées par le paludisme. le plus fréquemment isolé dans ce groupe Parmi les autres cas d’iNTS avec un frottis sanguin négatif pour le paludisme,% / souffraient d’anémie et% / avaient une anémie sévère Bien que pas encore analysé, nous soupçonnons que l’infection palustre pourrait contribuer aux taux élevés d’iNTS observés En général, les limitations rapportées pour TSAP s’appliquent également ici, car les données analysées dans cette étude ont suivi la procédure standard multipays TSAP. s Des limites supplémentaires existent pour les analyses effectuées dans cette étude: La classification rurale / urbaine des villes de la zone d’étude était basée sur la taille de la population, des informations générales sur l’accès aux services publics et aux infrastructures publiées par le recensement de la population et l’opinion d’expert de l’enquêteur local; une définition plus complexe, basée sur des éléments résumant les caractéristiques rurales / urbaines et les aspects socio-économiques, pourrait aboutir à une répartition différente des villes considérées comme rurales ou urbaines; les données sur l’accès à l’eau et aux installations sanitaires n’ont pas été collectées auprès des patients recrutés, ce qui rend difficile de tirer des conclusions sur cet important facteur de risque d’infection à S. Typhi; Une étude cas-témoin n’a pas été réalisée pour identifier les facteurs de risque associés aux bactériémies à Salmonella et leurs variations entre les milieux. Les études futures devraient examiner quels facteurs de risque pourraient contribuer aux taux plus élevés observés ici et le rôle qu’ils jouent dans les différences rurales et urbaines.

CONCLUSIONS

Incidences des bactériémies à Salmonella chez les enfants & lt; ans du Ghana étaient élevés, avec & gt; Les résultats soulignent l’impact des propriétés communautaires en tant que facteurs de risque pour les salmonelloses invasives et remettent en question le point de vue commun selon lequel la fièvre typhoïde est principalement une maladie des populations à forte densité. Ces données épidémiologiques pourraient soutenir les experts de la santé publique. décideurs politiques pour identifier les mesures de contrôle, y compris les stratégies vaccinales et les exigences de gestion des patients dans les sociétés en transition des pays en développement

Remarques

Remerciements L’International Vaccine Institute IVI remercie Soo-Young Kwon, Hye-Jin Seo et Hyon-Jin Jeon pour leur soutien administratif et logistique durant la mise en œuvre du projet. Avertissement Les conclusions et conclusions contenues dans ce document sont celles des auteurs et ne reflètent pas nécessairement les positions ou les politiques du projet de loi et Fondation Melinda Gates Soutien financier Cette recherche a été financée par le projet de loi & amp; Melinda Gates Foundation OPPGH IVI reconnaît ses donateurs, y compris la République de Corée et l’Agence suédoise de coopération au développement international Cette publication a été rendue possible grâce à une subvention du projet de loi & amp; Melinda Gates Foundation OPP Supplément parrainé Cet article figure dans le supplément «Programme de surveillance de la fièvre typhoïde en Afrique TSAP» parrainé par l’International Vaccine Institute Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit d’intérêt potentiel Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Les conflits que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués